Potreban je biološki filter,a mali unutarnji to nije.Biološka filtracija se odvije u filterima većeg volumena gdje stavljamo biološki filtracijski materijal,od raznih šupljikavih materijala gdje se naseljavaju nitrifikacijske bakterije,tek nakon 60 dana neprekidnog rada.Postupak se može skratiti stavljanjem kulture nitrifikacijskih bakterija.Svako rasturanje filter-materijala i ispiranje prekida funkciju nitrifikacijskih bakterija i sve se mora ponoviti.
Nitrati se mogu ukloniti i mjenjanjem vode,ali u gušće naseljenom akvariju barem 50% dnevno(pojedini uzgajivači mjenjaju 100%/dan).Biljke u akvariju smanjuju nitrate jer ih iskorištavaju za svoju ishranu.Siguran znak da voda sadrži nitrate je neugodan miris,kao po bari.
Ako je voda čista i bistra voda to ne znači da u sebi ne sadrži nitrate.